Sunshine 用户指南(6/7):Sunshine Single 软件操作

软件引导设置,实验后一次操作即可自动清洗

Sunshine Single 是自动化纳米颗粒合成系统,能把 mRNA、siRNA、DNA 等载荷快速包封进纳米颗粒(通常是脂质或聚合物颗粒)。它用可重复使用的 Sunny 微流控芯片混合反应物、形成颗粒,软件一步步引导用户设置实验。每条实验结束后,用户只需操作一次,系统就自动完成清洗,可以直接做下一个配方。

电脑要求

Sunshine Single 随机配一台运行仪器的电脑。软件只在满足以下条件的电脑上运行:

升级软件时,先卸载旧版,再运行新版安装程序。卸载不影响保存实验数据的文件夹。

连不上仪器时,软件进入演示模式

软件启动时先显示加载界面,提示正在连接仪器。连接成功就进入主页。

Sunshine Single 主页:左上角是菜单按钮,右上角是窗口控制按钮,中间四个动作按钮依次为 Run experiment、Completed runs、Initialize instrument、Prime flowpath。

菜单三项:主页、关于、压力归零

主页由菜单按钮、动作列表和常规窗口按钮组成。点菜单出现三项:

归零前,仪器里不能有残余压力。最简单的办法是先润洗流路,再让泵空闲 30 秒后归零。

报过压之后,必须先成功润洗一次流路,才能归零。

初始化:选对 Sunny,软件按它定流速

每次打开软件,运行实验前都要先初始化硬件。可以在主页点 Initialize instrument,也可以直接开始设置实验:仪器还没初始化时,软件会弹窗提示。

从主页初始化时,弹窗里有下拉菜单,选择当前装在仪器上的 Sunny。初始化会设定阀位并排空注射器,把系统里的液体经 Sunny 推到废液。不同 Sunny 的通道宽度不同,最大流速也不同,所以选的 Sunny 决定初始化用的流速。

初始化弹窗:下拉菜单列出 9 种 Sunny,选择当前装在仪器上的那片。

点 OK 开始初始化。初始化一旦开始就不能中止。完成后弹出确认窗口,再点 OK 回到主页。

润洗:每天开工先跑一次

润洗流路时,注射器吸液、排液两次,再吸满备用。这样能把系统流路完全冲一遍,清掉污染物并排出空气。首次安装仪器或更换驱动液时,也用润洗把储液瓶里的驱动液充满系统。

润洗前准备三件事:

选好 Sunny 后点 Confirm and proceed 开始润洗。润洗时显示 Priming monitor,列出进度、两个进液通道的当前压力,以及 Abort priming 按钮,可以中途中止。完成后点 Done 回到主页。

Priming monitor:进度条显示润洗进度,下方是 Input 1、Input 2 的实时压力,右上角是 Abort priming 按钮。

润洗不是开始实验的必要条件,但养成两个习惯:每天开工先润洗一次,换驱动液时润洗一次。不清楚仪器上次什么时候用过,就先换上新鲜驱动液,润洗后再做实验。驱动液要定期更换,保持最佳状态。

参数页实时校验,变成 Valid 才能下一步

在主页点 Run experiment,进入 Experimental info and parameters 页设置实验。页面上点 Cancel 回到主页;点 Prime flowpath 开始润洗,此时按本页选的 Sunny 确定润洗流速。

需要填写的参数有:两路 Input 的流速比、配方名、最终样品体积、总流速(TFR)、头切和尾切体积,以及所用 Sunny。软件据此算出每路的流速(Calculated FR)和用量(Calculated vol.)。下图故意填了超限的值,红字列出了各项允许范围:

参数:允许范围

流速比(每路):1–10

每路算出的流速:0.05–10 mL/min

每路算出的用量:0.17–5.07 mL

最终样品体积:0.1–10 mL

总流速(TFR):0.1–20 mL/min

参数页超限示例:流速比 11、TFR 30 mL/min、样品体积 12 mL 等都超出范围,各框下方红字写明允许范围,右下角 Experiment check 显示 Invalid。

还有一个不太显眼的边界:单次实验的总时间有上限,因为一次实验可推送的驱动液总量有限。流速比很高(大于 8:1)、算出的样品用量又接近 5.07 mL 上限时,实验会超出可用的推送体积。这时减小最终样品体积,或降低流速比,直到 Experiment check 显示 Valid。

参数组合合适后,Experiment check 显示 Valid,Next 按钮变为可用。点 Next 时仪器若还没初始化,会提示先初始化;已初始化就进入装载确认页。

装载确认:六步备好仪器

装载确认页(Loading confirmation)一步步引导用户完成实验前的实物准备,共六步。每完成一步,勾选左侧描述旁的复选框,自动进入下一步。熟悉流程的用户可以点右下角 Check all and proceed,在确认弹窗里直接进入运行。

装载确认页:左侧是六个准备步骤,右侧仪器图标出当前这一步要操作的位置。

收集管提示随样品量切换:左为 2 mL 管(收集 1.000 mL 样品),右为 15 mL 管(收集 5.000 mL 样品)。

注射器接好、最后一个复选框勾上后,Start 按钮变为可用,点击即开始实验。

运行中三次弹窗,按提示操作

实验开始后,Run monitor 页显示实验状态和进度、关键运行信息汇总和本次实验参数。进度条下方显示两个泵通道的压力,供参考。

注入反应物提示:把两支注射器里的反应物注入进样环,注完注射器留在注样口上。

冲洗注样口提示:往 Luer 注样口注入 1 mL 合适溶剂,把残余样品冲进进样环。

点 OK 后进入系统清洗:自动冲洗流路、进样环、Sunny 和收集针,系统回到干净状态,可以直接做下一条实验。实验完成后出现 Report 和 Finish 按钮,点 Finish 回到主页。

中止后怎样恢复,看反应物是否已经放出

Run monitor 页右上角有红色 Abort experiment 按钮。实验中任何时刻点它并确认,所有硬件动作立即停止,实验中止。中止的实验不能续跑,但可以在 Completed runs 里重复。中止后会弹窗提示:运行下一条实验前先润洗流路,因为中止时流路里可能还有反应物。

反应物还没放进流路:可以接着用

反应物已经放进主流路:先清洁再继续

这时反应物无法回收。由于实验结束时的常规清洗没有完成,反应物还留在系统里。按以下步骤让系统恢复干净:

中止后开始的下一条实验,也会弹窗提醒先完整润洗系统。

报告可存为 PDF,每条实验单独一个数据文件夹

实验完成后点 Report,进入报告页。报告页汇总运行信息和实验参数,运行信息里还列出 Input 1 和 Input 2 达到的最高压力。页面右上角有三个按钮:

报告页:左侧是实验参数,右侧是运行信息(含两路最高压力),右上角三个按钮依次为 Experiment Log、Save as PDF、Open logs folder。

看完报告,点右下角 Done 回到主页。

日志文件在哪

每条实验都有自己的文件夹。里面有三个文件:运行日志(Run Log,.csv);完整数据日志,记录每个硬件状态的更多数据;记录本次参数的配置文件。往上一级是 C:\Sunshine\Data,能找到其他实验的文件夹。

一条实验的文件夹:Data Log、Run Log 和 Config file 三个文件。

C:\Sunshine\Logs 下还有:

技术支持排查问题时可能会要这些日志。为保证软件性能,日志文件夹超过 500 MB 时,90 天前的日志会自动删除。重要的日志请复制到别处长期保存。

历史运行:一键重复,按文件夹管理

在主页点 Completed runs,表格列出这台仪器做过的全部实验。选中一行,点右下角 Report,回到该实验完成时的报告页,可以从那里打开日志、另存 PDF。

重复实验:选中后点 Repeat selected run,打开参数页,该实验的所有参数都已填好。实验名会换成新实验的默认名,保证文件名不重复。

从列表移除:列表显示 C:\Sunshine\Data 下所有带配置文件的实验文件夹。要永久移除某条:

例如某条实验中止或需要重做,又想沿用列表里已有的实验名,就需要先移除旧的。把文件夹放回 C:\Sunshine\Data,它会重新出现在列表里。

报错与常见问题

过压报警

泵通道向流路出液时,压力传感器测到超过 10 bar,就报过压。初始化、润洗和实验中都可能出现。过压很少见,可能的原因有:

出现过压时,弹窗指出哪个通道超过了 10 bar。过压会自动停止所有硬件动作,并中止当前方案。对每个通道的报警点 Clear 清除报警状态。实验中报过压,实验会中止,下次实验前同样会提醒先润洗流路。查原因和疏通 Sunny 的方法,见第 7 篇。

润洗中报过压:Input 1 和 Input 2 两个泵通道都超过 10 bar,各有一个 Clear 按钮。

连接中断

任何硬件模块断开连接时,都会弹窗提示。检查它的连接和电源,再点 OK 重新连接。

常见问题

问题:解答

软件能装在 iOS、Linux 等系统上吗?:Sunshine Single 软件运行在 Windows 系统上。

能提供经过确认、有文档的系统吗?:Unchained Labs 提供 IQ/OQ 服务,对仪器功能做更详细的测试和验证,并出具报告。系统要求和购买事宜,联系当地 Unchained Labs 代表。

连不上仪器:确认用的是 Unchained Labs 随附的 USB 线,所有硬件模块都已通电。每个模块有两个电源开关:背面电源线旁的翘板开关,和正面的绿色按钮,两个都要在开的位置。

软件出现意外错误:本篇没有涵盖的错误,截图发给 support@unchainedlabs.com。要继续工作,多数情况下关闭软件、给硬件断电重启、再打开软件即可解决。

软件无响应:关闭软件(必要时用任务管理器),再重新打开。仍不能解决,联系 support@unchainedlabs.com。