紫外分光光度法 · 第 0 篇 · 导论
提完质粒测 A260 算 DNA、纯化完蛋白测 A280 算浓度、养菌时测 OD600 看密度。核酸、蛋白、菌液这三类最常见的场景,用的是同一套方法。在微量仪器上,一次只用 2 µL 样品,几秒钟就出数。
紫外到底在测什么、为什么 2 µL 就能出数、局限又在哪里,都要回到分子吸光的原理上。
场景一,发酵培养。菌液摇到下午,要判断继续摇还是已经到了接种密度。实验台上的微量紫外仪,2 µL 一滴,几秒钟后屏幕跳出 OD600 = 0.83,够不够接种当场就能定。
场景二,质粒提取。菌摇完、试剂盒柱子过完,要知道提到的 DNA 够不够下一步用、有没有蛋白或苯酚污染。2 µL 上到 Lunatic 板,A260 = 0.6,换算 30 ng/µL,A260/A280 比值 1.85,浓度够用、纯度合格。
场景三,抗体纯化。Protein A 柱收下来一排管,每管 2 µL 测 A280。人 IgG 在 1 cm 光程下消光系数约 1.37 (mg/mL)⁻¹,读数除以 1.37 就是 mg/mL。一排管很快测完,浓度高的合并冻存,稀的丢掉。
三个场景看着不同,共同的是:几秒钟出一个直接能用的数,三个场景都不用试剂,也不用标准曲线。
图 1 · 紫外分光光度法的三种日常。液滴柱式微量仪测核酸,Lunatic 板式 96 孔并行测蛋白,96 孔板读 OD600 看菌液浊度。同一个方法,三种规模。
仪器让一束光穿过溶液,记下它被吸收了多少。
溶液里的分子吸收特定波长的光,吸收多少,和它们的浓度成正比。整个定量的逻辑就这一条。
为什么蛋白测 280 nm,核酸测 260 nm?吸收波长由分子结构决定:
只要分子里有共轭双键或芳香环,就通常在 200–800 nm 有特征吸收。而生物大分子(蛋白、核酸、辅酶、代谢产物)几乎都满足这个条件。这是紫外定量应用范围广的根本原因。
不止蛋白和核酸。按实验室里的常见场景分类,至少八大类:
场景 / 波长 / 测的是什么 / 实际怎么用
蛋白定量(A280 法):波长 280 nm;测的是什么 Trp、Tyr、二硫键;实际怎么用 算 ε,读 A280,直接出浓度
蛋白定量(A205 法):波长 205 nm;测的是什么 肽键;实际怎么用 不依赖芳香氨基酸,对"没有 Trp"的蛋白友好
核酸定量:波长 260 nm;测的是什么 嘌呤 + 嘧啶;实际怎么用 微量仪读 A260,乘因子(dsDNA 50、RNA 40)
核酸纯度:波长 260 / 280 / 230 nm;测的是什么 蛋白、苯酚、盐污染;实际怎么用 比值法看干净程度
酶动力学:波长 340 nm;测的是什么 NADH / NADPH;实际怎么用 跟踪辅酶消长,反算酶活
菌液:波长 600 nm;测的是什么 细菌散射;实际怎么用 OD600 估细胞密度
显色蛋白定量:波长 562 / 595 / 750 nm;测的是什么 蛋白和染料 / 铜离子复合物;实际怎么用 BCA / Bradford / Lowry 比色
小分子药物:波长 各特征峰;测的是什么 药物本身的紫外吸收;实际怎么用 对照品比较法(药典标准)
表里只有显色法要加试剂、做标准曲线,其余几项都直接读吸收。这张清单还偏保守,没算上 Tm 熔解曲线、DNA 高温变性、辅酶 Q 还原态监测这些更专门的场景。
图 2 · 从 205 nm 到 750 nm,生物实验室最常用的八大波长节点。上下交错的标签按分类色区分蛋白(橙/蓝/橙红/绿)、核酸(青绿)、辅酶(紫)、菌液散射(绿)。
表中的场景各用各的波长和换算方式,背后都是同一个吸光原理。
紫外不是新方法。1729 年 Bouguer 研究光通过介质的衰减,1852 年 Beer 把浓度写进了公式。1913 年 Luther 给出今天课本上的 A = εcb。110 多年过去,这条公式没换过。
它至今还在生物实验室天天用,靠的是速度和样品量。
它也有局限:
干扰怎么处理,见本系列的「样品处理」;线性范围的边界,见「Beer-Lambert 定律」。
10 篇,由浅入深:
# / 内容 / 你能带走什么
0:内容 导论(本篇);你能带走什么 紫外能测什么、不能测什么的全景
1:内容 光是什么;你能带走什么 为什么是 200–800 nm?上下界各从哪来
2:内容 Beer-Lambert 定律;你能带走什么 公式每个字母的含义、什么时候会失效
3:内容 仪器内部;你能带走什么 Lunatic、比色皿仪器、其他微量仪之间,读数为什么能对齐
4:内容 A280 测蛋白 + 显色法;你能带走什么 ε 是"算"出来的,为什么还需要 BCA / Bradford
5:内容 A260 测核酸;你能带走什么 1.8 / 2.0 这个经验值到底有多不靠谱
6:内容 浑浊样品;你能带走什么 散射校正、导数光谱、什么时候该过滤
7:内容 更多场景;你能带走什么 酶动力学的 NADH 通道;OD600 其实测的是散射
8:内容 样品处理;你能带走什么 比色皿、缓冲液、污染,每次读数波动的原因
9:内容 合规之路;你能带走什么 中国药典对紫外仪查什么,按它放行时厂商交付什么、实验室还要自己复测什么
每一篇都附一手来源:Agilent 技术白皮书、经典论文、中美欧三部药典的紫外章节。
Owen T. Fundamentals of Modern UV-Visible Spectroscopy. Agilent Technologies, 2000. · Stoscheck C. M. Quantitation of Protein. Methods Enzymol. 1990, 182, 50–68. · Desjardins P., Conklin D. NanoDrop Microvolume Quantitation of Nucleic Acids. J. Vis. Exp. 2010, 45, e2565. · Mayerhöfer T. G., Pahlow S., Popp J. The Bouguer-Beer-Lambert Law: Shining Light on the Obscure. ChemPhysChem 2020, 21, 2029–2046.