【Webinar】Lunatic 测核酸:不用染料,不用稀释
关于本次 Webinar
一个 5 万人的生物样本库项目,DNA 定量从荧光染料法换成 Lunatic,按讲者的估算可省约 6.5 万美元耗材和 7.8 万美元人工。省下的主要是稀释和标准曲线:荧光法两样都要,试剂也贵,而且只报浓度不管纯度。
Lunatic 把全光谱 UV/Vis 吸光度做到了微流控板上:每孔 2 µL 样品,常规板约 5 分钟读完 96 个孔,测高浓度用的 high 板约 10 分钟。微比色皿光程固定,浓度直接按吸光度算,不用染料,也不用标准曲线;high 板读到 275 OD,高浓度样品也不用稀释。DNA 或 RNA 的浓度和纯度一次出结果。
对照 NIST 标准,Lunatic 的 准确度在 2% 以内,精度 1% CV。荧光法只报浓度,全光谱 UV/Vis + Unmix 还能看出杂质:5.5 mM EDTA 会抑制 PCR,Unmix 在定量的同时就把它识别出来,据此判断样品能否进入后续测序。
### 你将了解到
- 00:00:00 · 00:01:53 · 开场介绍 · 主持人介绍演讲者 Ross Walton 博士。
- 00:01:53 · 00:03:01 · 荧光法的痛点 · 荧光染料法步骤繁琐,稀释多、耗时、易出错。
- 00:03:01 · 00:04:07 · 荧光染料线性范围窄 · PicoGreen 高浓度会饱和,Lunatic 动态范围宽。
- 00:04:07 · 00:05:00 · Lunatic 概览 · 2 µL 样品,单光程板上 96 样品约 5 分钟,SBS 兼容液体工作站。
- 00:05:00 · 00:06:45 · 微流控板技术 · 固定光程微比色皿,动态范围 0.03-275 OD。
- 00:06:45 · 00:07:25 · 加样过程演示 · 滴入 2 µL,样品通过毛细作用进入储液池。
- 00:07:25 · 00:09:20 · 高通量与生物样本库成本对比 · 5 万人项目节省 6.5 万美元耗材 + 7.8 万美元人工。
- 00:09:20 · 00:11:22 · 准确度与精密度验证 · NIST 标准验证:准确度 2%、精度 1% CV。
- 00:11:22 · 00:12:45 · 高浓度样品 high Lunatic 板 · 常规板 40 OD,high 板 275 OD。
- 00:12:45 · 00:15:40 · Unmix 识别污染物 · 算法解卷积,识别浊度/蛋白/磁珠残留。
- 00:15:40 · 00:17:10 · EDTA 污染案例 · 5.5 mM EDTA 会抑制 PCR,Unmix 同时定量和识别污染。
- 00:17:10 · 00:20:10 · UK Biobank 案例 · 50 万人基因分型项目,Welsh 等 2017 发表。
- 00:20:10 · 00:22:00 · All of Us 研究计划 · NIH 资助 100 万人计划,Mayo Clinic 样本库。
- 00:22:00 · 00:23:10 · Personalis NeXT Personal · 这款 ctDNA 液体活检检测做分析验证时,用 Lunatic 定量富集前文库浓度。
- 00:23:10 · 00:25:00 · Aarhus 大学 MoMA 核心实验室 · RNA-seq 核心服务,研究性染色体非整倍体。
- 00:25:00 · 00:25:40 · 总结 · 一台 Lunatic 把基因组样品的浓度和质量一次测完。
- 00:25:40 · 00:33:30 · Q&A 问答环节 · 6 个问题:动态范围、全板时间、样品类型、Unmix 杂质、零点校准、纯度要求。
- 荧光法要稀释和标准曲线,Lunatic 在 96 孔微流控板上做 UV/Vis 定量,为什么都不用
- 理解荧光法定量在 NGS 工作流中的局限
- 掌握如何用 Unmix 识别并量化样品中的常见污染物
- 看看生物样本库和高通量实验室如何把 Lunatic 用于 DNA 定量、归一化与 QC