A280 读高了?可能是散射在干扰

紫外分光光度法 · 第 6 篇

A280 读高了?可能是散射在干扰

实验室里的蛋白样品经常浑浊:纯化早期的上清、冻融后的抗体制剂、LNP 样品、高浓度抗体、离心没离干净的样品。测这类样品的 A280,散射会把算出的浓度抬高。Mach 1992 统计的蛋白里,散射分量多数不超过 2%,晶状体蛋白可达 7%。抬高的原因在仪器:它分不清散射和吸收,把散射也算进了吸收。处理办法有 330 nm 校正、二阶导数光谱和物理过滤,各有自己的物理前提和适用样品。

散射为什么被误读成吸收

吸收和散射在物理上是两种过程。吸收是分子把光子的能量接收下来,用来让电子跃迁到高能级,最后以热或荧光释放。散射是光子遇到颗粒或分子后改变传播方向,能量本身没变。紫外分光光度计的检测器只数到达的光子有多少,所以没到达的光子是被吸收了,还是被偏转到其他方向,它分不清。

散射有多强,取决于波长。对远小于波长的颗粒,散射服从瑞利散射规律:光强与波长的四次方成反比,即 I ∝ λ⁻⁴。按这个规律,280 nm 的散射是 560 nm 的 16 倍,约是 330 nm 的 2 倍。波长越短散射越强,而蛋白的吸收峰恰好在短波紫外区,所以 A280 受散射影响最大。

蛋白本身在 320-350 nm 区间几乎没有吸收。所以在这个"应该平坦"的区域测到可读的吸光度,就是散射的标志。Pace 1995 给了一个经验判断:溶液在 325 nm 以上还能读出吸收,就是散射在干扰。Mach 1992 也观察到,散射会在 280 nm 处产生一个表观吸光度,仪器把它算成吸收。

A330 因此成了天然的散射诊断波长:读数明显高于零,就说明散射在干扰你的 A280。

图 1 · 左:瑞利散射的 λ⁻⁴ 曲线,280 nm 散射强度约是 330 nm 的 2 倍、560 nm 的 16 倍。右:测量光谱、散射基线和校正后光谱的关系,A₂₈₀(真)= A₂₈₀(测)− 1.929 × A₃₃₀。

方法一:Pace 1995 的 330 nm 校正

Pace 1995 比较了多种蛋白消光系数测定方法,同时给出了一个散射校正公式:

A₂₈₀(真)= A₂₈₀(测)− 1.929 × A₃₃₀

1.929 这个因子来自瑞利散射的 λ⁻⁴ 规律:(330/280)⁴ ≈ 1.929。如果测量波长是 278 nm,校正因子变为 1.986 × A₃₃₀。

快速估算时,Pace 还给了更简便的近似:2 × A₃₃₃ ≈ 280 nm 处的散射贡献,或 2 × A₃₃₁ ≈ 278 nm 处的散射贡献。

散射校正的幅度有多大?Mach 1992 用了 32 个蛋白的实测数据,结果大致是:

β-乳球蛋白校正后的 ε 是 16,650 M⁻¹cm⁻¹,文献里常见的未校正值是 17,550,差了约 5%。做精密定量时,这个差距已经不能忽略。

但这个公式有个前提:它假设散射是纯瑞利散射,即颗粒直径远小于光波长。如果浑浊来自大颗粒聚集体、可见沉淀、或脂质纳米颗粒,λ⁻⁴ 规律不成立,1.929 这个因子会失效。Pace 1995 也写明,这几个简化算法都假设散射强度与波长四次方成反比。遇到这类样品,应该改用物理过滤,不要硬套公式。

方法二:导数光谱

如果散射背景不是简单的 λ⁻⁴ 规律,或者样品光谱复杂、有多个重叠峰,二阶导数光谱是另一条路。

它利用的是两者曲率的差别。散射随波长变化很慢,求二阶导数后几乎变平;蛋白吸收是尖锐的峰,求导后仍有明显的负峰或正峰结构。所以求导能把背景拉平,峰反而更明显。

导数光谱能进入日常使用,靠的是 Savitzky 和 Golay 1964 年的一篇论文。他们提出把多项式最小二乘拟合转化为卷积运算。做法是用 2m+1 个连续数据点拟合 n 次多项式(n <2m+1),每个窗口对应一组整数系数。光谱数据与这组系数做卷积求和,就得到平滑后或求导后的值。

简单移动平均会压低峰值;简单差分对噪声敏感,会放大毛刺。Savitzky-Golay 用最小二乘拟合代替直接平均,平滑后的峰形基本不失真。

窗口和多项式次数要按光谱来选:

导数光谱适合几类场景:

代价是对信噪比敏感,需要足够强的原始信号。它的计算量比 330 nm 校正大,但现代仪器软件已内置这一步。

方法三:物理过滤

如果散射来自真实颗粒,最直接的办法是把颗粒去掉。

Pace 1995 在干重法和 Edelhoch 法前都用 0.2 µm Acrodisc 过滤膜过滤样品。

过滤适合有可见颗粒、气泡多、离心沉不下去的聚集体。

以下样品不宜过滤:

这些样品可以改用下面的办法:

怎么选:一张决策表

样品特征 / 推荐方法 / 注意点

A₃₃₀ 轻微升高,样品澄清:推荐方法 Pace 330 nm 校正;注意点 快速,不改变样品

A₃₃₀ 明显升高,有可见颗粒:推荐方法 0.2 µm 过滤或离心;注意点 过滤有吸附损失风险

散射规律不明(非瑞利散射嫌疑):推荐方法 二阶导数光谱;注意点 需要信噪比足够

光谱复杂,多组分重叠:推荐方法 二阶导数光谱;注意点 分辨 Trp/Tyr 精细结构

低浓度、易吸附、样品珍贵:推荐方法 离心 + 330 nm 校正;注意点 避免膜接触

同时怀疑聚集(不仅是散射):推荐方法 Stunner DLS 联用;注意点 区分"有颗粒"vs"单纯散射"

图 2 · 三种方法的横向对比(330 nm 校正 / 二阶导数光谱 / 物理过滤)。另附决策流:按 A₃₃₀ 和可见颗粒判断走哪条路。

Lunatic 和 Stunner 上的散射处理

微量板式紫外仪一次读完全光谱,A330 随读数一起给出,不用像传统分光光度计那样换波长再手动算。

Lunatic 和 Stunner 每次测 A280/A260 时同时读出 A330,软件可直接显示散射校正后的 A280。Protein (Turbidity) 应用按瑞利散射与波长的关系,在全光谱上扣除散射,不只用 330 nm 一个点。

Stunner 多一层诊断:同一次测量里还测 DLS(动态光散射),能直接判断样品里有没有颗粒或聚集。A330 升高可能来自散射,也可能来自其他因素,DLS 可以把两者分开。DLS 显示有颗粒,就回到制备环节优化工艺或加一步过滤;DLS 干净,A330 升高多半另有来源,先查缓冲液和杂质的吸收,不要直接套散射校正。

Lunatic 的参数:96 通量、每孔 2 µL、光程 0.5 mm 或 0.1+0.7 mm。样品少到不便过滤时,离心后取上清,再用 330 nm 校正。

参考来源

Pace C. N., Vajdos F., Fee L., Grimsley G., Gray T. How to measure and predict the molar absorption coefficient of a protein. Protein Science 1995, 4, 2411-2423. · Mach H., Middaugh C. R., Lewis R. V. Statistical Determination of the Average Values of the Extinction Coefficients of Tryptophan and Tyrosine in Native Proteins. Analytical Biochemistry 1992, 200, 74-80. · Savitzky A., Golay M. J. E. Smoothing and Differentiation of Data by Simplified Least Squares Procedures. Analytical Chemistry 1964, 36(8), 1627-1639.