Leprechaun Flex 抗体功能化实验流程
Leprechaun Flex 抗体功能化实验流程
Flex Luni 要先用自定义抗体功能化,才能做背景扫描和样品孵育。抗体经缓冲液交换和浓缩后与 Flex Linker 偶联,淬灭后不需要纯化,稀释 1:100 加到 Luni 上孵育 30 分钟即可。这套流程适用于 Lentivirus Flex RNA Kit、Lentivirus Flex EV Contaminant Kit、Exosome Human Tetraspanin Flex Kit、Exosome Human Plasma Flex Kit,以及可分析任何样品类型的 Leprechaun Flex Kit。Flex Conjugation Kit 冷链运输,收到后请把偶联试剂存放在 −20 °C 冰箱中。
试剂盒内容与存储
Flex Conjugation Kit 组件
组件 / 数量 / −20 °C
Flex Linker 1:数量 100 µg;−20 °C ✓
Flex Linker 2:数量 100 µg;−20 °C ✓
Flex Modifier:数量 100 µL;−20 °C ✓
Flex Quencher:数量 100 µL;−20 °C ✓
其他试剂的存储条件请参考对应的 Leprechaun Kit 说明。
Luni Washer 组件(单独销售)
Solution A (10X) / 100 mL / 4–8 °C
Solution B (10X):100 mL 100 mL;4–8 °C 4–8 °C
Luni Washer 24 Well Plates:100 mL 10;4–8 °C 室温
额外所需设备
- —1X DPBS 或 1X PBS(推荐 Gibco DPBS Catalog# 14190144)
- —30 kDa MWCO 超滤管(推荐 Amicon Ultra-0.5, EMD Millipore Catalog# UFC503008)。每种抗体需一根独立的超滤管
- —台式离心机
- —涡旋混合器
- —1.5 mL 反应管
- —分光光度计(用于测定蛋白浓度)
- —去离子水(推荐 Fisher Scientific Catalog# LC267404)或电阻率达 18.2 MΩ·cm 的超纯水
- —EMS 风格碳纤维尖头细尖镊子(推荐 Fisher Scientific Catalog# 50-193-0842)
开始前准备
关键参数
- —每管 linker(100 µg)偶联一种抗体
- —缓冲液交换前最少需要 50 µg 抗体
- —交换后可偶联的抗体最佳范围:40–100 µg
- —偶联效率最佳的最大体积:100 µL
- —Luni 的背景扫描放在 Flex Conjugation Protocol 完成之后
- —功能化完成的 Flex Luni 可在 4 °C 过夜保存,但需在 24 小时内使用
Solution A 和 B 配制
10X Solution A 和 10X Solution B 随所有 Leprechaun kit 提供,使用前需稀释 10 倍。
- —1X Solution A:将 30 mL Solution A (10X) 与 270 mL 去离子水混合在 500 mL 无菌瓶中。储存在 4 °C
- —1X Solution B:将 15 mL Solution B (10X) 与 135 mL 去离子水混合在 250 mL 无菌瓶中。储存在 4 °C
抗体缓冲液兼容性
开始前请确认抗体缓冲液的成分符合以下要求:
缓冲液成分:要求
pH:6.5–8.5
无胺缓冲液 Amine-free buffer:✓
非缓冲盐 Non-buffering salts:✓
螯合剂 Chelating agents:✓
糖类 Sugars:✓
甘油 Glycerol:≤25%
硫柳汞 Thiomersal/Thimerosal:✗
硫柳汞酸钠 Merthiolate:✗
叠氮钠 Sodium-azide:≤0.1%
BSA:✗
明胶 Gelatin:✗
甘氨酸 Glycine:✗
Tris:≤50 mM
ProClin300:≤0.01%
硼酸缓冲液 Borate buffer:✓
亲核组分 Nucleophilic components:✗
推荐偶联前对所有抗体做缓冲液交换;只含 PBS 和 0.1% 叠氮钠的缓冲液不会明显干扰偶联。
Section 1:缓冲液交换与抗体浓缩
- 1.1 用分光光度计测定抗体的起始浓度(IgG 在 280 nm 的消光系数为 210,000 M⁻¹cm⁻¹)。 - —推荐将抗体浓缩至终浓度 0.5 mg/mL(溶于 1X DPBS 或 1X PBS)
- 1.2 用微型离心机短暂离心抗体 5 秒,再取至少 50 µg 抗体加入 30 kDa MWCO 超滤管,用 1X DPBS 补至 500 µL。
- 1.3 9500 × g 离心 4 分钟,19 °C(或室温)。
- 1.4 取出超滤管,弃去滤液。加入 400 µL 1X DPBS,9500 × g 离心 4 分钟,19 °C(或室温)。
- 1.5 弃去滤液,加入 400 µL 1X DPBS,9500 × g 离心 8 分钟,19 °C(或室温)。此时体积应约为 50 µL。
- 1.6 将超滤管反转放入新的收集管中,收集浓缩后的抗体。
- 1.7 350 × g 离心 2 分钟,19 °C(或室温)。
- 1.8 目视确认抗体回收,丢弃超滤管。涡旋 3 秒,微型离心机短暂离心 5 秒。
- 1.9 再次用分光光度计测定浓缩后抗体的浓度: - —用 DPBS 做空白。在 A280 nm 处测定浓缩抗体,使用抗体对应 Ig 亚型的消光系数
- 1.10 用 DPBS 调整体积,使终浓度为 0.5 mg/mL。
浓度计算示例:
IgG 消光系数(280 nm):210,000 M⁻¹cm⁻¹
分光光度计读数(IgG 设置):2 mg/mL
回收抗体体积:40 µL
需加入的 DPBS 体积 = [(测得浓度 × 回收体积) / 目标浓度] − 回收体积
= [(2 mg/mL × 40 µL) / 0.5 mg/mL] − 40 µL = 120 µL
Section 2:抗体-linker 偶联
Flex Linker 1 和 Linker 2 的偶联流程相同。
使用 Lentivirus Flex RNA 和 Lentivirus Flex EV Contaminant Kit 时:Flex Linker 1 必须偶联自定义包膜抗体;Flex Linker 2 偶联对应的同型对照抗体。
- 2.1 取出一管 Flex Linker、Flex Modifier 和 Flex Quencher,室温平衡 10–15 分钟。
- 2.2 标记一根新反应管"Antibody + Modifier"。涡旋 Flex Modifier 3–5 秒。
- 2.3 取 80 µL 浓缩后的抗体转移至新管中,加入 8 µL Flex Modifier(绿色盖子)。上下吹打 4–5 次轻柔混匀。
- 2.4 将 80 µL 上述混合物加入 linker 管中。上下吹打混匀。此步骤启动偶联反应:linker 被重悬并开始偶联。室温静置 45 分钟,不要振摇。
- 2.5 加入 8 µL Flex Quencher(红色盖子)终止反应,室温静置 15 分钟。
- 2.6 将抗体-linker 偶联物转移至新管中,4 °C 保存。
本试剂盒无需额外的纯化步骤。
未使用的试剂盒组件保存在 −20 °C(参考试剂盒内容与存储部分)。
Section 3:抗体-linker 偶联物在 Flex Luni 上的孵育
每个 Luni 需要 35 µL 稀释后的偶联物,按使用的 Luni 数量算出总体积。
- 3.1 将抗体-linker 偶联物用 1X Solution A 稀释 1:100(即取 1 µL 偶联物加入 99 µL 1X Solution A)。
Linker 1 和 Linker 2 的偶联物可以同时使用。将两者混合加入 1X Solution A,按 1:100 稀释,即 1 µL Linker 1 偶联物 + 1 µL Linker 2 偶联物 + 98 µL 1X Solution A。
- 3.2 将 Luni 放入 Luni Washer 24 孔板的指定孔位,Luni ID 朝向干燥斜台(ramp)。
- 3.3 向每个 Luni 上加入 35 µL 稀释后的偶联物,室温静置 30 分钟,不要振摇。
- 3.4 孵育完成后,将 24 孔板放入 Luni Washer,确保 A1 孔位于左上角,合上盖子。在触摸屏上选择 Flex Prep。
- 3.5 按 First Strip,输入含有 Luni 的第一行编号。
- 3.6 按 Number of Strips,输入含有 Luni 的总行数。
- 3.7 按 Start。
- 3.8 提示将 Luni 移至干燥斜台时,转到 Section 4 操作。
Section 4:Luni 干燥
- 4.1 提示时将 Luni 移至干燥斜台。移动过程中,Luni 要始终浸没在液面下。按 Continue。
- 4.2 程序完成后,取出 Luni 放在吸水垫上,Luni ID 朝上。完全干燥后方可使用。
至此,Flex Luni 已用所选抗体完成功能化。
功能化后的 Luni 必须先进行背景扫描,再进行样品孵育。
- section-1 · 缓冲液交换与浓缩
- section-2 · 抗体-linker 偶联